Под особым вниманием органов ВЧК-ОГПУ в годы нэпа находились верхи буржуазной интеллигенции. Это являлось частью контроля государства с целью не допустить политического влияния оппозиции, «заставить... не участвовать активно в контрреволюции...»Чекистам в своей работе было рекомендовано исходить из ленинского совета о важности расслоения буржуазной интеллигенции и усиления ее колебаний, ибо «через эти колебания идет одна, самая твердая линия: контрреволюцию отсекать, культурно-буржуазный аппарат использовать». Именно такой подход, по мнению Дзержинского, обеспечивал изоляцию радикальных элементов и поддержку тех, кто стоял на позиции активной помощи правительству.
Основные задачи в сфере экономики по линии ведомства безопасности решались Экономическим управлением и Транспортным отделом ВЧК-ОГПУ. Дзержинский считал, что в новых условиях
ЭКУ должно способствовать развитию народного хозяйства, а ТО - содействовать восстановлению и развитию транспорта. Он постоянно нацеливал чекистские органы на всемерное оказание помощи наркоматам на хозяйственном фронте. Выступая на совещании представителей ВЧК, Цектрана и НКПС о работе ТЧК и их роли на транспорте, он отмечал, что главная задача ТЧК - помогать НКПС, а общество «Транспорт»(Первое акционерное транспортное предприятия, в состав которого входили и государственные предприятия - Авт.) «в своей работе должно встретить со стороны Госполитуправления полное содействие...». В конце октября 1925 г. Председатель ОГПУ отдал распоряжение о тесном взаимодействии подразделений ОГПУ с учреждениями ВСНХ: оказывать органам ВСНХ всемерное зависящее содействие, усилить наблюдение за злоупотреблениями и преступлениями в области торгов-. ли, с личными еженедельными мне докладами начальника ЭКУ.
После Гражданской войны была распространена практика сочетания чекистской работы с работой в хозяйственных учреждениях, что являлось выполнением решения Коллегии ВЧК от 5 марта 1921 г.: «Каждый более или менее ответственный чекист должен получить какую-нибудь работу в хозяйственных органах республики, совмещая эту работу с работой в ЧК. В каких хозяйственных органах должны работать чекисты, нужно распределить через Высший Совет Народного Хозяйства. Все это должно быть сделано с согласия ЦК. При переходе сотрудников ЧК в другие советские учреждения они не должны прерывать связь с ЧК, а, наоборот, всеми мерами помогать последним». Изучив детально структуру того учреждения, в котором они работают, о всех замеченных недостатках и преступных деяниях регулярно сообщать в местный орган ЧК, поддерживая постоянную связь».
В общем - то это не было чем-то необычным. Сам председатель ВЧК-ОГПУ, оставаясь на этих постах, возглавлял сначала НКПС, а затем - ВСНХ. Его заместители фактически постоянно работали в различных наркоматах. Другие руководители одновременно трудились в местных советских и хозяйственных структурах.Даже после увольнения из губЧК (отделов ГПУ) их бывшие сотрудники были обязаны не прерывать связей с территориальными органами. После реорганизации ВЧК и сокращения штатов многие чекисты перешли на заводы и фабрики, в гражданские учреждения, вернулись в села и стали оказывать всемерное содействие чекистам.
При ведении борьбы с преступностью в сфере экономики одним из сложных вопросов были проблемы арестов и судов. С одной стороны, следовало наказывать совершивших преступление, с другой- делать это с учетом положения переступившего закон, как это могло повлиять на работу учреждения или предприятия.
28 февраля 1920 г. Политбюро ЦК РКП(б) 26 января 1921 г. Дзержинский направил телеграмму всем губчека, особым отделам и РТЧК о том, что по имеющимся в ВЧК сведениям, местные органы ЧК производят аресты квалифицированных специалистов, работающих по важнейшим отраслям промышленности страны, обвиняя их в контрреволюции во время пребывания в белой армии, «чем парализуется налаживающаяся созидательная работа» и предложил «прекратить аресты специалистов по обвинению в «старым делам», также немедленно освободить специалистов, арестованных по вышеуказанным мотивам, под поручительство ответственных коммунистов, заинтересованных в работе», а 28 апреля 1921 г. его заместитель Уншлихт подписал приказ, в котором начальникам ТЧК было «предложено» при арестах специалистов проявлять особую осмотрительность».
На этом же настаивали и руководители наркоматов и партийных органов. Например, нарком продовольствия А.Д. Цюрупа прямо заявил, что нельзя ставить «карательную политику во главу угла», сам же Дзержинский считал, что «карательной системой нельзя нам аппарат исправить. Я придаю борьбе классовый характер, характер борьбы с частновладельческими инстинктами...».
Да и другие руководители ГПУ пришли к выводу о том, что существовавшая практика привлечения к суду за мелкие проступки и упущения по чисто формальным признакам наносила большой вред работе хозяйственных органов. Поэтому ими было предложено провести 4 апреля 1923 г. совещание с участием представителей НК РКИ, НКЮ и ГПУ под руководством А.Д. Цюрупы, на котором обсудить порядок привлечения к суду и следствию руководителей хозяйственных органов.
На более осторожном подходе при предании хозяйственников к суду настаивал председатель управления коммунистической торговли при СТО А.М. Лежава. В письме в Президиум ВЦИК 6 апреля 1923 г. он ходатайствовал о смягчении наказаний работникам государственной торговли, делая упор на том, что с увеличением судебных процессов растет и число правонарушений. «Выношу вполне определенное убеждение, - писал он, - что, уничтожая по приговорам судов отдельных, выдающихся по своему практическому уму и энергии преступников, мы вместе с тем убиваем в массе остающихся в живых честных и преданных работниках энергию, творчество и инициативу. Это страшно, ибо такой паралич, столь необходимой нам энергии, конечно, не ограничится кратким временем, но может стать глубоко разлагающим, психологическим фактором... наши репрессии прошли мимо своей цели, они взрывают нас самих. Жутко, что наши лучшие работники в своих чувствах и переживаниях так восприняли наш суд и наш закон».