В начале 1920-х гг. на заседаниях Оргбюро ЦК РКП (б) стали систематически заслушиваться доклады секретарей губкомов. Наряду с общими вопросами партийной работы обсуждалась деятельность чекистских подразделений. Дзержинский часто присутствовал на этих заседаниях и выступал с деловыми предложениями. Так, 1 марта 1924 г.он обратился к В. Р. Менжинскому с просьбой представлять материалы по линии ОГПУ «за 2 дня до заседания». Дзержинский хорошо знал важнейшие дела, касавшиеся работы чекистских органов: «О всех возникающих делах и важнейших докладах в ЦКК, РКИ, НКЮст, ЦК РКП (б)... докладывать предварительно и лично мне...». Наиболее принципиальные вопросы он выносил на обсуждение в высшие партийные и советские инстанции, часто обращаясь непосредственно в Политбюро, Оргбюро, Секретариат ЦК РКП (6), СНК, ВЦИК и к руководителям наркоматов. При необходимости всестороннего согласования обсуждаемых вопросов, затрагивающих интересы других государственных органов, Феликс Эдмундович предлагал их решать на межведомственных совещаниях. Так, говоря о привлечении к суду и следствию ответственных работников хозяйственных органов, он считал целесообразным созвать «совместное совещание, на котором ГПУ, НКЮст И РКИ внесли бы согласованные предложения».
Дзержинский считал, что уж если решено провести совещание, то должна быть обеспечена своевременная явка всех заинтересованных лиц. Еще 11 мая 1918 г. на заседании ВЧК было заслушано его предложение о необходимости принятия крайних мер для точной и аккуратной явки членов комиссии на заседания. Было решено «обратиться к членам Комиссии от лица настоящего собрания с приглашением обязательной явки на специальное заседание Комиссии для выяснения, как этого, так и общеорганизационных вопросов относительно численного состава пленума Комиссии. Началом заседаний Комиссии и Бюро в дальнейшем установить 6 часов вечера. Заблаговременно оповещать о заседаниях всех членов Комиссии под их личную расписку.
Вместе с тем он выступал за упорядочение проведения заседаний и совещаний, и учил чекистов дорожить каждой минутой времени, заботиться о повышении работоспособности сотрудников, резко выступал против заседательской суетни, поглощавшей много времени, и требовал максимального сокращения различного рода совещаний. В записке, направленной начальнику ЭКУ ОГПУ Г. И. Благонравову и другим, он указал, что «эти заседания столь сильно вошли в нашу практику, что необходимы огромные усилия всех ответственных работников, чтобы свести их до минимума». «Может быть, - писал Дзержинский, - обязать ввести обычай на каждом заседании первым пунктом ставить вопрос: нужно ли это заседание и кто из присутствующих может и должен быть освобожден от участия в нем, нельзя ли было вопрос разрешить без заседания». Настаивая на ликвидации ненужных совещаний и заседаний, он исходил также из того, чтобы не «забирать дорогое время и силы других органов», дать возможность сотрудникам отдохнуть и «немного подремонтироваться. Иначе мы очень скоро лишимся всех работников». Дзержинский запрети «практику отвлечения работников от их дела», считая ее неправильной.
Такие рекомендации председателя ВЧК-ОГПУ сегодня весьма актуальны для сотрудников государственного аппарата, когда многие руководители увлекаются бумаготворчеством, предпочитая его общению с конкретными исполнителями принятых решений, совершенно не беспокоясь о потерянном времени.
3 июня 1926 г. Дзержинский еще раз вернулся к вопросу о роли совещаний в работе: «Самым большим бедствием для нас в настоящее время является бесконечное обилие всяких заседаний, поглощающих бесконечно много времени без достаточных результатов, не окупающих ни в какой мере потерянных часов; эти заседания столь сильно вошли в нашу практику, что необходимы огромные усилия всех ответственных работников, чтобы свести их до минимума. Для этого необходимо, чтобы каждый работник вел борьбу с этим злом и оказывал сопротивление, когда его вовлекают на заседания, на которых он мог бы и не участвовать без ущерба для дела...
Роль начальников должна сводиться больше именно к руководству, т.е. определении линии и наблюдению, чтобы линия была правильной. Вопросы практически во всем объеме должны больше даваться определенному работнику, который «сам должен согласовать с кем следует, если встретится к этому деловая необходимость. (У нас же согласование больше для формалистики, чем по существу надобности). За данную работу должен работник целиком сам отвечать...».
Важнейшее значение в работе чекистов Ф. Э. Дзержинский придавал методам организационного воздействия (администрированию), то есть методам, отражающим использование руководителем предоставленных ему властных полномочий для укрепления дисциплины и ответственности подчиненных. При этом он подчеркивал, что разумное администрирование невозможно без использования мер убеждения, воспитания, развития творческой инициативы - все это призвано было подкрепить и усилить административные меры. В организационные методы Дзержинский включал методику подготовки, принятие и реализацию решений, распределение ответственности, организаторскую работу (нормирование, планирование, поддержание дисциплины, инструктаж, обобщение передового опыта).
В начале 1920-х гг. в Советской России возникло движение за внедрение элементов научной организации труда, которое вскоре приняло массовый характер. Дзержинский указывал, что научная организация труда невозможна без совершенствования его нормирования с учетом данных науки, квалификации и опыта, без постоянного повышения сознательности, укрепления дисциплины, добросовестного выполнения каждым сотрудником своих обязанностей, согласованной работы всех чекистских подразделений. Правильная организация труда рассматривалась им как первооснова его эффективности, как общий результат, который получается от общих усилий. Председатель ВЧК-ОГПУ принимал живейшее участие в улучшении организации труда в своем ведомстве, рекомендовал активно использовать в работе чекистского аппарата, изучать работы Центрального института труда (Москва), Казанского института научной организации труда, Всеукраинского института труда (Харьков). По его указанию в чекистских подразделениях были созданы многочисленные кружки и ячейки по НОТ, «лиги времени», занимавшиеся изучением оптимальных способностей человека в процессе работы, реализации организационных методов.