Для осуществления плана заговорщики сосредоточили в городе офицеров, в их руках были 3 военные школы. Выступление предполагалось начать в Вишняках, Волоколамске и Кунцеве, отвлечь туда советские силы, а затем поднять восстание в самом городе. В подробном плане Москва была разбита на секторы по Садовому кольцу, за Садовым кольцом на улицах предполагалось устроить баррикады, укрепиться по линии Садового кольца и повести оттуда в некоторых пунктах наступление к центру.
Заговорщики были настолько уверены в победе, что заготовили даже ряд воззваний и приказов, которые говорят и о характере «Национального центра» и штаба «Добровольческой армии Московского района»(военная организация во главе с генералом Н.Н. Стоговым и полковником В.В. Ступиным). «Национальным центром» руководили кадеты, в штабе же были в большинстве черносотенцы.
Чтобы вооружить своих сторонников, они сосредоточили оружие в школах, которые были под их влиянием, а также закупили на складах.
Силы их, по подсчетам, составляли 800 кадровых офицеров, кроме того, они рассчитывали на некоторые части, в которые им удалось послать своих людей. Благодаря большим связям в штабах, они расставили своих людей там, где это считали необходимым.
2 августа 1919 г. заместитель председателя Особого отдела ВЧК И. П. Павлуновского представил В.И. Ленину доклад о «Национальном центре», который субсидировался Антантой и Колчаком. Эта организация снабжали белых разведывательной информацией и готовились при приближении войск Деникина поднять восстание.
В докладе отмечалось, что «Национальный центр» объединял кадетов - проантантовски настроенных бывших членов «Правого центра», представителей Церковного собора, торгово-промышленных кругов. Возглавлял НЦ бывший октябрист Д.Н. Шипов, затем кадеты М.М. Федоров и Н.Н. Щепкин. Центр претендовал на роль главного штаба контрреволюционных сил в борьбе против советской власти за создание «единой и неделимой России», установление «военно-буржуазной диктатуры». Осенью 1918 г. правление НЦ переехало в Киев, затем в Одессу, а в ноябре -в Екатеринодар. Отделения НЦ были в Петрограде, Москве, Ростове-на-Дону, Таганроге, Харькове, Батуми, Тбилиси, Баку других городах.
По поводу «Национального центра» по докладу И.П. Павлуновского 23 августа 1919 г. В.И. Ленин писал: «Т. Дзержинский!
1. На прилагаемую бумажку, т. е. на эту операцию, надо обратить сугубое внимание. Быстро и энергично и пошире надо захватить.
2. Газета «Народ» имеет тесные связи с правыми эссерами. Не закрывая ее, надо их выследить».
Под руководством Дзержинского были разработаны мероприятия по раскрытию заговоров противников советской власти. О тщательной отработке им оперативных документов свидетельствует подготовка инструкции по проведению специальной операции в Москве: «Рабочих не брать, если нет прямого приказа; проверить, прописаны ли и отмечать в протоколе; в квартирах оставлять засады, дав им строгое предписание конспирации, бдительности и не отпускания кого бы то ни было из зашедших; телефоны с момента обыска выключить; всю одежду в большом количестве забирать, обыски производить с 5-ти часов утра; исходным пунктом операции не должно быть МЧК, ни ВЧК, цель - настоящую операцию замаскировать; наметить лиц, подлежащих заключению в одиночку; дать инструкцию обыска сараев, чердаков, подвалов; забрать все документы, письма и писанное; прежде всего производить личный обыск, отнимая все, обратить внимание, чтобы не пропали и не перемешались записные книжки, записки, заметки; фотографировать сейчас же всех, если не хватит сил в одиночку, то группами; забрать на обысках все фотографические карточки».
Разгрому заговорщиков помог сигнал одной из учительниц о подозрительных лицах, задержание в Вятской губернии человека с большим количеством денег, оружием и затем его попытки передать из тюрьмы записку сообщнику. Только по делу штаба было арестовано около 700 человек, а общее число арестованных превысило 1000 чел.
Кроме того, чекисты раскрыли английскую разведывательную сеть. Была ликвидирована и группа анархистов, причастных к теракту в Леонтьевском переулке. Зацепкой для чекистов послужила находка у одного из задержанных письма о взрыве. Следствие по «Национальному центру» позволило выйти на другую организацию -«Тактический центр», который объединял «Национальный центр», «Союз возрождения России» и «Совет общественных деятелей». В результате операции чекистов оказались под арестом все члены московского и петроградского «Национального центра», этой «будущей власти», члены их военно-технической организации, вспомогательные агенты и т. д., всего около 700 человек. На следствии они стали выдавать друг друга, что помогло ВЧК раскрыть всю сеть заговорщиков. Большинство арестованных были пойманы с поличным. Чекисты захватили десятки шпионских донесений, сведений о советских войсках, приказов и инструкций из «Добровольческой армии» Деникина, шифрованных записей, адресов и оружия.
По филиалам «Национального центра» чекисты нанесли удары в конце 1919-весной 1920 г. Но свое существование он прекратил с разгромом белого движения. В 1920 г. были также ликвидированы Польская военная организация и ряд белогвардейских разведывательных групп.
Что же касается фронтовых дел, то их у Дзержинского добавилось с 18 августа 1919 г., когда он был рекомендован ЦК РКП б) на должность начальника Особого отдела ВЧК, а 27 августа РВС
Республики объявил о назначении его на этот пост с оставлением на постах председателя ВЧК и наркома внутренних дел.